Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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