Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RESTQ13127 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
RESTQ13127 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RESTQ13127 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RESTQ13127 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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RESTQ13127 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RESTQ13127 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RESTQ13127 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RESTQ13127 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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