Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRDNQ13061 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRDNQ13061 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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