Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK2Q13002 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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