Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXO1Q12778 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXO1Q12778 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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