Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4BQ07343 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4BQ07343 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms