Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms