Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBXN1Q04323 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms