Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCNT1Q02742 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms