Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms