Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSF1Q00613 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms