Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNB1P98172 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms