Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMF1P82094 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMF1P82094 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMF1P82094 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMF1P82094 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMF1P82094 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMF1P82094 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMF1P82094 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMF1P82094 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMF1P82094 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMF1P82094 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMF1P82094 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMF1P82094 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TMF1P82094 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMF1P82094 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMF1P82094 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMF1P82094 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMF1P82094 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMF1P82094 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMF1P82094 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMF1P82094 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMF1P82094 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMF1P82094 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms