Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS16P62249 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS16P62249 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS16P62249 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS16P62249 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS16P62249 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS16P62249 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS16P62249 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS16P62249 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS16P62249 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS16P62249 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS16P62249 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS16P62249 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS16P62249 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS16P62249 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms