Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2MP61081 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms