Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RAB5BP61020 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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RAB5BP61020 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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RAB5BP61020 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RAB5BP61020 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RAB5BP61020 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RAB5BP61020 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RAB5BP61020 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB5BP61020 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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