Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP25P60880 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP25P60880 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms