Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTBP60709 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTBP60709 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms