Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms