Protein–RNA interactions for Protein: P58743

SLC26A5, Prestin, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A5P58743 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC26A5P58743 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms