Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTTPP55157 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTTPP55157 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTTPP55157 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTTPP55157 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTTPP55157 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTTPP55157 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTTPP55157 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTTPP55157 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTTPP55157 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTTPP55157 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTTPP55157 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTTPP55157 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms