Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP12AP54707 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms