Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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