Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLK1P49759 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLK1P49759 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLK1P49759 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLK1P49759 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLK1P49759 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLK1P49759 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms