Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTPAP49638 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTPAP49638 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTPAP49638 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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