Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNNI2P48788 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNNI2P48788 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms