Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIP4K2AP48426 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PIP4K2AP48426 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms