Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GALR1P47211 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GALR1P47211 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GALR1P47211 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GALR1P47211 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GALR1P47211 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GALR1P47211 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GALR1P47211 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GALR1P47211 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GALR1P47211 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GALR1P47211 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GALR1P47211 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GALR1P47211 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GALR1P47211 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GALR1P47211 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GALR1P47211 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms