Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIK3CBP42338 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms