Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNCAP37840 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNCAP37840 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNCAP37840 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNCAP37840 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNCAP37840 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNCAP37840 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNCAP37840 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNCAP37840 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNCAP37840 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNCAP37840 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNCAP37840 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNCAP37840 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNCAP37840 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNCAP37840 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNCAP37840 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms