Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJA4P35212 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GJA4P35212 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GJA4P35212 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
GJA4P35212 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GJA4P35212 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GJA4P35212 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJA4P35212 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJA4P35212 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJA4P35212 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms