Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASQ1P31415 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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