Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA13P31271 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms