Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A5P29400 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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