Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB9P28065 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms