Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTX3P26022 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTX3P26022 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTX3P26022 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTX3P26022 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTX3P26022 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTX3P26022 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTX3P26022 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTX3P26022 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTX3P26022 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms