Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRR1P24046 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms