Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGS1P23219 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGS1P23219 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms