Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGFR3P22607 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms