Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms