Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA2P17301 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms