Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSP16219 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSP16219 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms