Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM27P14373 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms