Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ODC1P11926 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ODC1P11926 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ODC1P11926 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms