Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIL1P09327 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VIL1P09327 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIL1P09327 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIL1P09327 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIL1P09327 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VIL1P09327 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VIL1P09327 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VIL1P09327 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIL1P09327 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms