Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYNP07948 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYNP07948 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYNP07948 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYNP07948 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYNP07948 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms