Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSLP07711 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSLP07711 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSLP07711 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTSLP07711 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTSLP07711 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTSLP07711 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTSLP07711 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSLP07711 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSLP07711 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSLP07711 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSLP07711 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSLP07711 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSLP07711 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTSLP07711 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms