Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC1P02654 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC1P02654 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC1P02654 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC1P02654 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC1P02654 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC1P02654 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC1P02654 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC1P02654 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOC1P02654 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOC1P02654 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms