Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL2A1P02458 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms