Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHG1P01857 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHG1P01857 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms